Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQF6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQF6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQF6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQF6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQF6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQF6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQF6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQF6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQF6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQF6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQF6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQF6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQF6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQF6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQF6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQF6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQF6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQF6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQF6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQF6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQF6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQF6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQF6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQF6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQF6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQF6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQF6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQF6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQF6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQF6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQF6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQF6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BQF6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BQF6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BQF6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BQF6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BQF6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BQF6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BQF6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BQF6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BQF6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BQF6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BQF6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BQF6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BQF6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BQF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BQF6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BQF6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BQF6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BQF6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BQF6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BQF6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BQF6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BQF6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BQF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BQF6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BQF6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BQF6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BQF6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BQF6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BQF6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BQF6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BQF6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BQF6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BQF6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BQF6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BQF6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BQF6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BQF6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BQF6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BQF6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BQF6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BQF6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BQF6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BQF6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BQF6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BQF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BQF6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BQF6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BQF6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BQF6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BQF6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms