Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3E7EW58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3E7EW58 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms