Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3BL2E5RIL1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3BL2E5RIL1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL2E5RIL1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms