Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP99D6REC4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP99D6REC4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP99D6REC4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms