Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRT4C9JH25 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT4C9JH25 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT4C9JH25 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms