Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TISP43B9A030 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TISP43B9A030 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TISP43B9A030 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TISP43B9A030 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TISP43B9A030 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TISP43B9A030 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms