Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK3BL1B0FP48 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPK3BL1B0FP48 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms