Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZK1P1A8MUH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1P1A8MUH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZK1P1A8MUH7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms