Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YJEFN3A6XGL0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YJEFN3A6XGL0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YJEFN3A6XGL0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YJEFN3A6XGL0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
YJEFN3A6XGL0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YJEFN3A6XGL0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YJEFN3A6XGL0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms