Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF25A6NGN4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF25A6NGN4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms