Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HELTA6NFD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HELTA6NFD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HELTA6NFD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HELTA6NFD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HELTA6NFD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HELTA6NFD8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HELTA6NFD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HELTA6NFD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms