Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L3A6NEY3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GOLGA6L3A6NEY3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA6L3A6NEY3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms