Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GMNCA6NCL1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GMNCA6NCL1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GMNCA6NCL1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GMNCA6NCL1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms