Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC144AA2RUR9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC144AA2RUR9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC144AA2RUR9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
CCDC144AA2RUR9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC144AA2RUR9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms