Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIPSLA2A3N6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIPSLA2A3N6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms