Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVT2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GVT2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVT2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GVT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms