Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAARA0A1B0GVQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAARA0A1B0GVQ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms