Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0U1RRA0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms