Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYK7

TRAV19, T-cell receptor alpha variable 19 (Fragment), humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV19A0A0A6YYK7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAV19A0A0A6YYK7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAV19A0A0A6YYK7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAV19A0A0A6YYK7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAV19A0A0A6YYK7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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