Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms