Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms