Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms