Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PGPEP1Q9NXJ5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PGPEP1Q9NXJ5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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