Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR88Q9GZN0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms