Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HIGD2AQ9BW72 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms