Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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