Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTV1Q96GA3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms