Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms