Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF182Q8N6D2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF182Q8N6D2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms