Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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COL5A1-AS1Q5SY13 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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COL5A1-AS1Q5SY13 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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