Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
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