Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL40Q2TBA0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms