Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms