Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOFQ13790 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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