Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms