Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR1P32246 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR1P32246 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR1P32246 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR1P32246 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR1P32246 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms