Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms