Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA1P17302 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA1P17302 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA1P17302 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA1P17302 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms