Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms