Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms