Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGFO15240 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGFO15240 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGFO15240 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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