Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF25A6NGN4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRAMEF25A6NGN4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms