Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ERG28Q9UKR5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms