Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SLC39A9Q9NUM3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SLC39A9Q9NUM3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms