Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms