Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms