Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK0

MARVELD1, MARVEL domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD1Q9BSK0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MARVELD1Q9BSK0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms