Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP6Q96RT7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms