Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms