Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms